以下是重叠和非重叠上游开放阅读框(uORFs)对翻译效率影响的总结:
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重叠uORFs:
- 重叠uORFs对主要编码区的翻译影响更为显著,因为它们直接与下游编码序列(CDSs)竞争核糖体结合。
- 重叠uORFs的翻译起始信号通常低于非重叠uORFs。这可以通过重叠uORFs相对于非重叠uORFs较低的相对翻译起始水平来证明。
- 重叠uORFs中,ATG起始的uORFs较少,且它们的Kozak序列得分(反映起始密码子的周围序列环境)较低。
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非重叠uORFs:
- 非重叠uORFs对下游CDS的翻译抑制作用较小,因为它们不直接与主要CDS竞争核糖体结合。
- 非重叠uORFs的翻译起始信号相对较高,这表明它们在调控翻译起始方面可能更为有效。
- ATG起始的非重叠uORFs具有更高的Kozak序列得分,表明其翻译起始效率较高。
总体而言,重叠uORFs由于与下游CDS的竞争,往往对翻译效率有更显著的抑制作用,而非重叠uORFs的影响则相对较小,且其翻译起始效率通常较高。
参考文献:
2023_Annotation of uORFs in the OMIM genes allows to reveal pathogenic variants in 5’UTRs